新能源科学与工程系（简称新能源系）成立于2020年11月，设有“新能源科学与工程”本科专业和自设交叉二级学科。新能源系现有专任教师26人，其中教授5人、副教授15人，省部级以上人才称号获得者6人，其中“四高四青”3人。在校本科生135人、硕士研究生12人、博士研究生2人。

新能源科学与工程专业依托国家双一流学科“矿业工程”，与动力工程及工程热物理、地质资源与地质工程、电气工程等学科深度交叉融合，聚焦地热能、煤层气、页岩油（气）等非常规地质能源的绿色开采、高效转化与储存、清洁利用等新技术。培养的学生基础理论扎实、实践能力强、综合素质高，深受行业企业、高等院校和科研机构青睐，在服务国家能源结构转型和“双碳”目标战略中发挥着重要作用。新能源科学与工程专业（080503T）属于能源动力类（0805），在矿业类招生。与中石化新星公司、中国长江三峡集团、金风科技、国家能源集团等15家行业头部企业合作建立了新能源专业各类型实习基地。

依托矿业工程一流学科，新能源科学与工程学科拥有国家重点实验室和教育部重点实验室各1个，设有中国矿业大学新能源科学与工程研究中心，与济宁市能源局共建新能源产业研究院。